PostGis es la extension "GIS" para PostgreSQL.
Para instalar en Ubuntu 14.04, aqui. Para instalar en Debian Wheezy (desde PostgreSQL 9.1) aqui.
Para usar estas extensiones desde Java con Hiberntate, aqui. Ojo a los espacios desde la linea de comandos.
Necesitaras crear un usuario en tu bd, aqui el comando. Luego crear la bd, aqui. Y añadirle todos los "scripts" que viste en los primeros links, a tu bd.
Algunas guias extra:
Esta y esta.
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